CentOS で（Eclipseを使って） Java の開発環境を整備するまでの手順を紹介します。
Eclipse を使うので、CentOS には X Window やデスクトップといったモジュールが導入されていることが必要です。
まず Eclipse のインストールそのものは簡単です。JDK を導入した上で最新版をダウンロードして展開してもいいですし、最新版でなくてもよければもっと簡単に yum でインストールすることもできます（以下、こちらの手順を使っている前提で紹介を続けます）：
yum を使う場合であれば JDK ごとインストールされてます。なお、2014/10/22 現在ですが、この方法でインストールされる Eclipse のバージョンは 3.6.1(Helios) でした。
加えてウェブアプリケーションの動作確認のため FireFox も導入しておきます：
インストールが完了したら、デスクトップのメニューから アプリケーション > プログラミング > Eclipse で起動できます：
初回起動時はワークスペースをどのディレクトリに作るか聞かれます。特に理由がなければデフォルトのままでも構いません。"Use this as the default and do not ask again" にチェックを入れておくと、次回起動時にこの質問は聞かれなくなります：
Eclipse が初回起動した時の画面です。チュートリアルなどは飛ばして、"Workbench" をクリックし、実際の作業画面に移ります：
実際にコーディングを行う作業画面がこちらです。最初の段階では何もプロジェクトがないのでのっぺらぼうですが、ここに作業するプロジェクトを追加していくことになります：
ただ、この段階ではまだ Eclipse に充分なプラグインが導入されていないため、Java のウェブアプリケーションを作るウィザードも使えませんし、デバッグ用のウェブアプリケーションサーバーも含まれていません。最低限必要な環境を追加していく必要があります。
Eclipse 作業画面のメニューから Help > Install New Software を選択して、プラグインの更新ダイアログを表示します。そして Work with: 欄に使っている Eclipse のバージョンに合わせた更新サイト（3.6.1 であれば http://download.eclipse.org/releases/helios）を指定します。しばらく待つと下に更新可能なプラグインの候補がカテゴリーに分類されて表示されます：
ここから必要なものを選択してチェックを付けていきます。まずは "General Purpose Tools" に分類されている "Marketplace Client" にチェック：
続けて "Web, XML, and Java EE Development" に分類されている "Eclipse Java EE Developer Tools" と "Eclipse Web Development Tools" の両方に（上記と併せて３つ）チェックします：
そして Next ボタンを２度クリックし、使用条件を確認した上で accept して、最後に Finish ボタンをクリックすると選択した３つのプラグインの導入が開始されます。プラグインの導入が完了すると Eclipse の再起動を促されるので、再起動（"Restart Now"）します。再起動後はこの３つのプラグインが有効になった状態で起動します。
この時点では Java アプリケーションプロジェクトを作成することはできるようになっていますが、まだデバッグ用のアプリケーションサーバーが用意されていません。Apache Tomcat などを別途導入してもいいのですが、ここでは簡単に導入できる Jetty をインストールして Eclipse 内から使えるようにします。
Eclipse の再起動後、今度はメニューから Help > Eclipse Marketplace を選択します（Marketplace も上記で導入しているので、再起動後からは使えるようになっているはずです）。
Marketplace ダイアログが表示されたら Find 欄に "Jetty" と入力して、Jetty 関連のマーケットモジュールを検索します：
この結果表示されるモジュールの中から、以下の３つをインストールします：
(1) Eclipse Jetty
(2) Run-Jetty-Run
(3) WebLauncher
Marketplace では３つまとめてインストールすることができないので、これらを１つずつ探して "Install" ボタンをクリックする、と繰り返します。そして３つ全てインストールし終わったら、再度 Eclipse を再起動します。これで準備完了です。
では改めてこの環境で Java アプリケーションを作って動かしてみましょう。Eclipse のメニューから File > New > Project を選択してプロジェクトウィザードを出し、Web の下にある "Dynamic Web Project" を選択して "Next" をクリックします。プロジェクトの名称は適当に（"TestWeb" など）入力します。他はデフォルトのまま "Finish" をクリックしてプロジェクトを作成します：
このプロジェクトにテスト用の JSP ファイルを１つ追加します。プロジェクト名部分を右クリックして New > File を選択し、このプロジェクトの WebContent フォルダ内に test.jsp というファイルを追加します：
追加作成した test.jsp を選択してエディタで開き、以下の様な内容を記入します。単純に現在時刻を表示するだけのページですが、Java を使っているので一応 Java ウェブアプリケーションと言えると思います：
では作成したこのアプリケーションを実際に動かしてみましょう。プロジェクトを右クリックして Run As > Run Jetty を選択します：
Eclipse 内で Jetty が（デフォルトでは 8080 番ポートで）起動します。これでこのプロジェクトが Jetty から参照できるようになっているので、同一マシンで FireFox を起動し、http://localhost:8080/TestWeb/test.jsp にアクセスしてみます：
動作が確認できました。ちゃんと Java ウェブアプリケーションの開発や動作確認までできる環境が揃いました！
以下はオマケですが、せっかく Linux 版 Eclipse をインストールしたので、Windows 版ではできない Terminal 機能を紹介します。Eclipse 内のビューを使ってターミナルコンソールを起動する、というものです。
先程と同様にメニューから Help > Install New Software を選択して、今度は "General Purpose Tools" 以下の "Local Terminal" をチェックしてインストールして、Eclipse を再起動します：
再起動後、Eclipse のメニューから Window > Show View > Other を選択し、Terminal の下にある Terminal を選択して OK をクリックします：
すると画面右下に "Terminal" という名前のタブが１つ追加されます。まだ有効になっていませんが、ここがターミナルコンソールとして使えるウィンドウになります：
実際にコンソールを使うにはタブ内の一番右のアイコン（マウスオーバーすると "New Terminal Connection in Current View" と表示される所）をクリックして、接続設定ダイアログを表示します。特に変更の必要はないので、そのまま OK ボタンをクリックします：
ターミナルコンソールが有効になり、シェルとして使えるようになります。これで別窓のシェルにいちいち移動する手間が省けます：
ただこの機能がまだ Incubation 段階だからなのかもしれませんが、このターミナルコンソールでは日本語が化けて表示されてしまうようです。日本語の入出力に依存するような自由な使い方はまだできない、という認識の元で使えそうです。
Eclipse を使うので、CentOS には X Window やデスクトップといったモジュールが導入されていることが必要です。
まず Eclipse のインストールそのものは簡単です。JDK を導入した上で最新版をダウンロードして展開してもいいですし、最新版でなくてもよければもっと簡単に yum でインストールすることもできます（以下、こちらの手順を使っている前提で紹介を続けます）：
# yum install eclipse
yum を使う場合であれば JDK ごとインストールされてます。なお、2014/10/22 現在ですが、この方法でインストールされる Eclipse のバージョンは 3.6.1(Helios) でした。
加えてウェブアプリケーションの動作確認のため FireFox も導入しておきます：
# yum install firefox
インストールが完了したら、デスクトップのメニューから アプリケーション > プログラミング > Eclipse で起動できます：
初回起動時はワークスペースをどのディレクトリに作るか聞かれます。特に理由がなければデフォルトのままでも構いません。"Use this as the default and do not ask again" にチェックを入れておくと、次回起動時にこの質問は聞かれなくなります：
Eclipse が初回起動した時の画面です。チュートリアルなどは飛ばして、"Workbench" をクリックし、実際の作業画面に移ります：
実際にコーディングを行う作業画面がこちらです。最初の段階では何もプロジェクトがないのでのっぺらぼうですが、ここに作業するプロジェクトを追加していくことになります：
ただ、この段階ではまだ Eclipse に充分なプラグインが導入されていないため、Java のウェブアプリケーションを作るウィザードも使えませんし、デバッグ用のウェブアプリケーションサーバーも含まれていません。最低限必要な環境を追加していく必要があります。
Eclipse 作業画面のメニューから Help > Install New Software を選択して、プラグインの更新ダイアログを表示します。そして Work with: 欄に使っている Eclipse のバージョンに合わせた更新サイト（3.6.1 であれば http://download.eclipse.org/releases/helios）を指定します。しばらく待つと下に更新可能なプラグインの候補がカテゴリーに分類されて表示されます：
ここから必要なものを選択してチェックを付けていきます。まずは "General Purpose Tools" に分類されている "Marketplace Client" にチェック：
続けて "Web, XML, and Java EE Development" に分類されている "Eclipse Java EE Developer Tools" と "Eclipse Web Development Tools" の両方に（上記と併せて３つ）チェックします：
そして Next ボタンを２度クリックし、使用条件を確認した上で accept して、最後に Finish ボタンをクリックすると選択した３つのプラグインの導入が開始されます。プラグインの導入が完了すると Eclipse の再起動を促されるので、再起動（"Restart Now"）します。再起動後はこの３つのプラグインが有効になった状態で起動します。
この時点では Java アプリケーションプロジェクトを作成することはできるようになっていますが、まだデバッグ用のアプリケーションサーバーが用意されていません。Apache Tomcat などを別途導入してもいいのですが、ここでは簡単に導入できる Jetty をインストールして Eclipse 内から使えるようにします。
Eclipse の再起動後、今度はメニューから Help > Eclipse Marketplace を選択します（Marketplace も上記で導入しているので、再起動後からは使えるようになっているはずです）。
Marketplace ダイアログが表示されたら Find 欄に "Jetty" と入力して、Jetty 関連のマーケットモジュールを検索します：
この結果表示されるモジュールの中から、以下の３つをインストールします：
(1) Eclipse Jetty
(2) Run-Jetty-Run
(3) WebLauncher
Marketplace では３つまとめてインストールすることができないので、これらを１つずつ探して "Install" ボタンをクリックする、と繰り返します。そして３つ全てインストールし終わったら、再度 Eclipse を再起動します。これで準備完了です。
では改めてこの環境で Java アプリケーションを作って動かしてみましょう。Eclipse のメニューから File > New > Project を選択してプロジェクトウィザードを出し、Web の下にある "Dynamic Web Project" を選択して "Next" をクリックします。プロジェクトの名称は適当に（"TestWeb" など）入力します。他はデフォルトのまま "Finish" をクリックしてプロジェクトを作成します：
このプロジェクトにテスト用の JSP ファイルを１つ追加します。プロジェクト名部分を右クリックして New > File を選択し、このプロジェクトの WebContent フォルダ内に test.jsp というファイルを追加します：
追加作成した test.jsp を選択してエディタで開き、以下の様な内容を記入します。単純に現在時刻を表示するだけのページですが、Java を使っているので一応 Java ウェブアプリケーションと言えると思います：
では作成したこのアプリケーションを実際に動かしてみましょう。プロジェクトを右クリックして Run As > Run Jetty を選択します：
Eclipse 内で Jetty が（デフォルトでは 8080 番ポートで）起動します。これでこのプロジェクトが Jetty から参照できるようになっているので、同一マシンで FireFox を起動し、http://localhost:8080/TestWeb/test.jsp にアクセスしてみます：
動作が確認できました。ちゃんと Java ウェブアプリケーションの開発や動作確認までできる環境が揃いました！
以下はオマケですが、せっかく Linux 版 Eclipse をインストールしたので、Windows 版ではできない Terminal 機能を紹介します。Eclipse 内のビューを使ってターミナルコンソールを起動する、というものです。
先程と同様にメニューから Help > Install New Software を選択して、今度は "General Purpose Tools" 以下の "Local Terminal" をチェックしてインストールして、Eclipse を再起動します：
再起動後、Eclipse のメニューから Window > Show View > Other を選択し、Terminal の下にある Terminal を選択して OK をクリックします：
すると画面右下に "Terminal" という名前のタブが１つ追加されます。まだ有効になっていませんが、ここがターミナルコンソールとして使えるウィンドウになります：
実際にコンソールを使うにはタブ内の一番右のアイコン（マウスオーバーすると "New Terminal Connection in Current View" と表示される所）をクリックして、接続設定ダイアログを表示します。特に変更の必要はないので、そのまま OK ボタンをクリックします：
ターミナルコンソールが有効になり、シェルとして使えるようになります。これで別窓のシェルにいちいち移動する手間が省けます：
ただこの機能がまだ Incubation 段階だからなのかもしれませんが、このターミナルコンソールでは日本語が化けて表示されてしまうようです。日本語の入出力に依存するような自由な使い方はまだできない、という認識の元で使えそうです。
