Node.js で MySQL データベースを利用する場合、npm の mysql ライブラリが多く使われると思っています:
mysql - npm


このライブラリを使うと、例えば SELECT 文を実行するのであれば、こんな感じに記述することで実装できます:
var Mysql = require( 'mysql' );

//. データベースへ接続
var mysql = Mysql.createConnection({
  host: '192.168.10.10',
  user: 'username',
  password: 'password',
  database: 'mydb'
});
mysql.connect();

//. SELECT 文実行
mysql.query( 'select * from items where price > 1000', function( error, results, fields ){
  if( error ) throw error;
  results.forEach( function( result ){
    var id = result.id;
       :
       :

    //. 終了
    mysql.end();
  });
});

また INSERT 文やプレースホルダーっぽい機能を使うこともできます:
var Mysql = require( 'mysql' );

//. データベースへ接続
var mysql = Mysql.createConnection({
  host: '192.168.10.10',
  user: 'username',
  password: 'password',
  database: 'mydb'
});
mysql.connect();

//. INSERT 文実行
mysql.query( 'insert into items set ?', { id: 1234, name: 'シャンプー', price: 500 }, function( error, result ){
  if( error ) throw error;
       :
       :

    //. 終了
    mysql.end();
  });
});

詳しくは上記公式ページを参照してください。


さて、MySQL では create table でテーブルを定義する際に blob(バイナリラージオブジェクト)型の列を指定することができます。画像ファイルなどバイナリデータをそのまま格納することができる列が定義できます:
> create table items( id int primary key, name varchar(50), price int, img blob );

定義は上記のように指定すればいいのですが、ではこの blob 列に、特に mysql ライブラリを使ってどのように指定すればデータを格納すればよいか、が今回のテーマです。特にウェブ画面から画像ファイルを指定してアップロードするような場合に、その画像ファイルの内容を具体的にはどのようにして blob 列に格納すればよいか、という内容です。

この要件について、少しググると MySQL の LOAD_FILE() 関数を使う方法が見つかります。この場合、具体的には以下のように記述します(目的の画像ファイルが /tmp/aaa.png に存在すると仮定します):
    :

mysql.query( 'insert into items set ?', { id: 1234, name: 'シャンプー', price: 500, img: LOAD_FILE('/tmp/aaa.png') }, function( error, result ){
: :

この方法はローカル MySQL サーバーに対しては有効に利用できます。LOAD_FILE() 関数はサーバー側のファイルシステムに対して実行されます。なので上記命令を実行してデータを格納する MySQL サーバーのファイルシステムに /tmp/aaa/png というファイルが存在していれば正しく動きます(命令を実行するクライアント側のファイルシステムにあっても動きません)。

しかし一般的なウェブシステムではウェブサーバーとデータベースサーバーは分離しています。そのようなケースでは(ウェブサーバーはデータベースクライアントになるので)ユーザーがウェブでアップロードしたファイルはウェブサーバーに一時格納されるだけで、データベースサーバーへは送られません。そこでウェブサーバー上で LOAD_FILE を実行してもデータは格納できないことになります。

では改めて、 LOAD_FILE() を使わずに blob データをどのように MySQL に格納するか、その方法がこちらです:
var fs = require( 'fs' );
    :
var img_content = fs.readFileSync( '/tmp/aaa.png' );
mysql.query( 'insert into items set ?', { id: 1234, name: 'シャンプー', price: 500, img: img_content }, function( error, result ){
    :
    :

ファイルシステムライブラリである fs をロードし、readFileSync 関数でローカルの(ウェブサーバー上の)バイナリファイルを読み込み、その結果をプレースホルダーに指定するだけです。

ちなみに取り出すときはこんな感じ:
    :
mysql.query( 'select * from items where id = 1234', function( error, results, fields ){
  if( error ) throw error;
  var img_content = results[0].img;
    :
    :

パフォーマンス等の観点からバイナリラージオブジェクトを MySQL などのデータベースに格納するべきか?という問題はあると思いますが、S3 ストレージなどの外部に格納する場合と比べて「データベースのバックアップ/リストアでオブジェクトごとバックアップ/リストアされる」というメリットはあります。用途に応じては使う価値があると思っています。